Jusqu’à un tiers des cas de variantes de coronavirus étaient des réinfections, selon les estimations de l’étude à Manaus – Jornal da USP

Des recherches effectuées sur des donneurs de sang révèlent une contamination par la variante P.1 chez des personnes qui ont déjà eu un covid

Par Júlio Bernardes

Une étude révèle que de nombreux cas de covid-19 causés par la variante P.1 sont des réinfections – Photomontage de Lívia Magalhães avec des images de Pixabay

Des recherches menées auprès de 238 donneurs de sang à Manaus, en Amazonie, révèlent que jusqu’à 31% des cas de covid-19 causés par la variante P.1 du coronavirus peuvent être des réinfections chez des patients qui ont déjà eu la maladie. Le nombre a été estimé dans une étude menée par le Centre Brésil-Royaume-Uni pour la découverte, le diagnostic, la génomique et l’épidémiologie des arbovirus (CADDE), avec la participation de chercheurs de l’USP. Les auteurs de l’étude soulignent que, comme l’étude a révélé que les cas de réinfection par P.1 sont fréquents, les personnes qui ont eu une contamination ne devraient pas manquer de se protéger.

La recherche est décrite dans un preprint (version précédente d’un article scientifique), publié sur le site medRxiv le 12 mai. Le but de l’étude était de déterminer si la réinfection par le variant P.1 du coronavirus est fréquente, en comparant la proportion d’infections et de réinfections.

Carlos Augusto Prete Junior – Photo: Reproduction / LinkedIn

«L’idée de rechercher une réinfection vient de deux motivations. Le premier provient d’autres études suggérant que P.1 induit une fuite immunitaire », rapporte le Journal de l’USP chercheur Carlos Augusto Prete Junior, de l’école polytechnique de l’USP (Poli), premier auteur de l’article. « L’autre est que la réinfection combinée à un taux de mortalité plus élevé en P.1 explique la deuxième vague à Manaus, qui a conduit à un nombre élevé de décès malgré la forte proportion de personnes infectées par la variante précédente. »

Selon le chercheur, il est très difficile de détecter une réinfection car la plupart des patients sont asymptomatiques et même les patients symptomatiques ont peu de chances d’être notifiés. «Pour cette raison, les patients qui ont eu deux infections confirmées et déclarées sont rares», souligne-t-il. «Pour surmonter ce problème, nous avons testé des échantillons stockés de donneurs de sang réguliers de Manaus, qui sont des donneurs qui donnent fréquemment, afin de détecter les infections asymptomatiques.

«L’idée de rechercher une réinfection vient de deux motivations. Le premier provient d’autres études suggérant que P.1 induit une fuite immunitaire. L’autre est que la réinfection combinée à un taux de mortalité plus élevé en P.1 explique la deuxième vague à Manaus, qui a conduit à un nombre élevé de décès malgré la forte proportion de personnes infectées par la variante précédente.

Comme le niveau mesuré d’anticorps diminue avec le temps, la réinfection entraînerait une augmentation soudaine du niveau d’anticorps, générant une courbe en forme de «V», explique Prete Júnior. « Il convient de mentionner que, pour que le taux d’anticorps augmente, il doit y avoir une réplication considérable du virus dans le corps », dit-il. « Par conséquent, une exposition au virus sans infection ne doit pas conduire à une augmentation du taux d’anticorps. »

L’enquête a sélectionné 238 donneurs non vaccinés qui ont donné au moins trois fois, au moins une fois lors de la première vague, qui a eu lieu l’année dernière, et une fois en 2021, lorsque P.1 est devenu répandu. «Nous avons classé ces donneurs en six groupes en fonction de leurs courbes d’anticorps: pas d’infection apparente, infection par un variant non P.1, infection par P.1, réinfection par P.1, réinfection probable par P.1 et éventuelle réinfection par P .1 », décrit le chercheur. « A partir du nombre de donneurs qui ont chuté dans chaque groupe, nous calculons des statistiques qui décrivent le comportement des réinfections. »

Comportement des réinfections

L’étude montre que 17% des cas de P.1 étaient des réinfections, une proportion qui augmente à 26% et 31% si des réinfections probables et possibles sont envisagées. Il montre également que les personnes infectées en 2020 ont un risque relatif de réinfection de 0,24 par rapport aux personnes non infectées, augmentant à 0,38 et 0,46 lorsque des réinfections probables et possibles sont envisagées.

Prete Junior souligne que les travaux ont révélé que les cas de réinfection par P.1 sont courants, et c’est pourquoi les personnes qui savent qu’elles ont été infectées ne devraient pas manquer de se protéger. «Le taux élevé de réinfection trouvé indique que les réinfections peuvent influencer la dynamique de l’épidémie, et par conséquent, les modèles épidémiologiques devraient envisager la possibilité d’une réinfection. En outre, le concept d’immunité collective n’est plus valable, car il peut y avoir de nouvelles foyers dans les communes à forte prévalence due à une réinfection », souligne-t-il. « Nous avons également montré qu’il est possible de détecter la réinfection en utilisant des donneurs répétés, et donc l’étude peut être reproduite dans d’autres pays et utilisée pour déterminer le taux de réinfection pour d’autres variantes. »

Le chercheur note que l’étude présente deux limites importantes: «Premièrement, la plupart des infections étaient asymptomatiques, et par conséquent, le taux de réinfection ne peut être pris en compte pour les patients plus sévères», explique-t-il. «Deuxièmement, l’échantillonnage des niveaux d’anticorps des donneurs est rare au fil du temps, et il peut donc y avoir des personnes qui ont eu tous les échantillons négatifs en 2020, mais qui ont en fait été infectées et testées négatives en raison de la décomposition des anticorps. Cela conduit à la possibilité de réinfections non signalées parmi les donneurs inclus dans l’étude. »

La réinfection par coronavirus avec la variante P.1 est fréquente – Photo: Freepik

«Il est important de noter que dans aucun des travaux avec les donneurs de sang, les gens n’ont eu accès au résultat du test. Pour cette raison, les échantillons ne sont pas biaisés pour les donneurs symptomatiques », explique Prete Junior. « Comme les personnes avec des cas confirmés ne peuvent pas donner pendant quelques semaines, il y a un léger biais en faveur des donneurs asymptomatiques. »

Les résultats de l’étude sont décrits dans l’article Réinfection par la variante SARS-CoV-2 P.1 chez des donneurs de sang à Manaus, Brésil, publié comme préimpression sur le site web de medRxiv le 12 mai. Les chercheurs de l’étude font partie du projet Brésil-Royaume-Uni pour la découverte, le diagnostic, la génomique et l’épidémiologie des arbovirus (CADDE) et ont eu la collaboration de chercheurs de plusieurs institutions, dont la USP Medical School (FMUSP), Poli, Université d’Oxford, Imperial College et London School, au Royaume-Uni, et University of California San Francisco (UCSF), aux États-Unis. Des chercheurs des centres de transfusion Hemoam, en Amazonie, et Hemominas, dans le Minas Gerais, ont également participé à l’étude.

Plus d’informations: e-mail carlos.prete@usp.br, avec Carlos Augusto Prete Junior

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